Génomique fonctionnelle et structurale des micro-organismes

  - Organisation, dynamique et plasticité des génomes microbiens et viraux.

  - Mécanismes physiologiques et génétiques assurant l'adaptation des micro-organismes à leur environnement naturel ou lors des processus industriels. Métabolomique.

  - Expression génique et sa régulation. Transcriptomique et protéomique.

  - Relations structure-fonction des enzymes microbiennes

Interactions  environnement / micro-organismes

  - Interactions des micro-organismes entre eux et avec leurs hôtes animaux ou végétaux dans les relations de saprophytisme, symbiose et pathogénicité.

  - Mécanismes de la pathogénicité (Virus, bactéries, champignons)

  - Signalisation et interaction microbiennes

  - Populations microbiennes en milieux complexes

Bio-ingénierie/biocatalyse 

  - Amélioration des biocatalyseurs (microorganismes, enzymes,…)

  - Conception et optimisation des procédés biologiques. 

  - Reconnaissance moléculaire et bioséparations

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